甲硝唑能治疗幽门螺杆菌感染，但是甲硝唑在治疗幽门螺杆菌感染的时候，需要联合使用一种质子泵抑制剂，比如奥美拉唑，兰索拉唑，泮托拉唑、艾司奥美拉唑等等，以及联合其他的一种抗生素，比如阿莫西林、克拉霉素以及呋喃唑酮等等。在正规进行治疗幽门螺旋杆菌是不能够单独的使用一种药物，一般需要联合使用抑制胃酸分泌、保护胃黏膜等药物治疗。甲硝唑可以作为治疗幽门螺旋杆菌感染方案中的一种药物，但甲硝锉，单独不能治疗幽门螺杆菌感染，幽门螺杆菌感染的治疗方案是四联药物联合应用，也就是一种质子泵抑制剂，一种铋剂，两种抗生素，服药时间为两周，单纯的一种药物是不能根除幽门螺杆菌的。
