肛裂形成的原因主要有以下几个:第一，解剖学因素。由于肛提肌大部分附着于肛管两侧，肛管后部与前部间隙均缺乏肌肉支持，所以容易在这两处形成肛裂。第二，生物力学因素。如果某些原因导致肛门内括约肌自发节律性收缩失常，就会引起肛管直肠功能状态失调，会导致肛裂。第三，便秘的因素。便秘时大便干燥，便线粗而硬，都有可能会导致肛管皮肤撕裂损伤。第四，饮食因素。当吃了辛辣刺激性的食物会引起括约肌的痉挛，粪便排出时也易造成肛裂。第五，炎症性因素。比如肛管的炎症就会引发肛裂的产生。第六，其它因素。包括先天性肛门畸形、外伤以及手术造成的术后肛门狭窄均有可能导致肛裂。
