1、医院中层管理干部职能部分的只要来源于临床专业技术人员、企鹅事业单位管理人员、国家公务员等，临床的中层干部在担任科室主任以前主要从事临床业务工作，普遍缺乏医院管理知识的系统培训，缺乏作为一名医院管理人员应该有的思维模式和职业精神。
2、在计划经济时代，医院按事业单位管理，在医院普遍缺乏经营意识的情况下，当然不会重视管理，更不会重视管理人才的培养，因此，直到今天仍然存在一方面医院现有的管理人员得不到应有的认可，另一方面又急需大批管理精英进入医院。
3、医院管理干部大多是在计划经济体制背景下提拔上来的，他们普遍缺乏市场意识和竞争意识，有的甚至有得得过且过的思想，院领导即使有改革魄力和创新思想，医院也有完善的管理方案，也不能保证90%以上的任务得到落实，有的甚至在落实中走了样。有的院领导在没有解决中层干部是否愿意做、是否有能力做的问题，就去解决应该怎么做的问题，其效果可想而知。
4、医院过分强调中层管理干部的责任心，不注重管理流程的设计和规范化，同时还缺少必要的激励机制，导致了管理效率的低下。
5、不重视或者说有的纯粹不懂管理人才的培养，造成了管理人才选拔困难，特别是业务科室的管理人才，要想做到从业务精、懂管理的优秀人才中选拔科室主任相当困难，最后只能是矮子里拔将军，选一个相比较各方面都不错的人了事。
6、缺乏一套科学的对中层管理干部进行业绩评价的指标体系，既不利中层管理干部的成长，也不能让业务人员服气。
7、医院中层管理干部普遍缺乏人格魅力，而手中权力又极其有限，因此很难提高团队的战斗力。
