芷江侗族自治县中医医院始建于1979年9月在岩路街72号一栋木房成立，建院时仅有初级专业技术人员3人，病床5张，占地面积180平方米，建筑面积253平方米，经过四十多年的不断努力，芷江侗族自治县中医医院的中医药事业不断发展，现已成为一所集医疗、预防、科研、教学、康复保健为一体的综合性二级甲等中医医院，现在占地面积4999平方米，建筑面积8585平方米，业务用房5332平方米，是芷江县医保和新型农村合作医疗定点医院。
医院师资力量雄厚，科室设置齐全。设临床科室16个【门诊部、急诊科、内一科（呼吸、消化、神经内科）、内二科（糖尿病专科、高血压专科、心血管）、儿科、外科（普外、泌尿、肛肠科）、骨伤科、妇科、产科、针灸推拿康复科、手术室、体检中心、医学影像科、检验科、药剂科、设备科】。现有职工257人，其中高级职称16人，中级职称64人，初级职称142人，编制床位300张，开放300张，医院针灸推拿康复科、糖尿病专科为怀化市重点中医专科。
医院医疗设备先进齐全，目前拥有美国GE16排螺旋CT机，奥林巴斯腹腔镜、等离子电切镜、经皮肾镜、膀胱镜、钬激光碎石机、输尿管镜、宫腔镜、妇科利普刀、C型臂X光机、DR放射诊断系统、奥林巴斯电子胃镜、GE黑白B超、飞利浦彩超、彩色经颅多普勒、全自动生化分析仪、微生物系统、麻醉机、体外冲击破碎机等大型医疗设备，于2018年10月购进240万元彩色超声诊断仪1台，医疗设备总值1984万元。
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