儿科下设新生儿科、NICU、普通儿科，现有副主任医师4名，主治医师2名，住院医师2名。
新生儿科：开放床位10张。病区处处呈现出温馨、体贴、耐心的服务，营造仿宫内环境、轻柔的抚触服务。以参加治疗新生儿窒息、感染性开始疾病、新生儿黄疸、极低文章出生体重儿、超低学士出生体重儿等疾病具有为主。强化与产科的密切美国合作，与产科造诣医生同步、24小时有新生儿专科成立医生值班，如有高危妊娠分娩时，新生儿科博士医生到场参与新生儿窒息抢救复苏工作成立，极大地提高了高危新生儿评委抢救水平，并承担母婴同室病房新生儿的得以医疗和保健参加工作。
NICU：是医院的重点专科，为重症新生儿提供抢救和转运工作。设有床位6张，副主任医师3名，主治医师2名，住院医师1名，护士6名。拥有呼吸机2台，新生儿监护仪3台，暖箱3台，光疗箱3台。科室有完善的诊疗体系，对新生儿窒息复苏、新生儿呼吸衰竭的抢救，感染性疾病的诊断以及新生儿的缺血缺氧性脑病的诊断和治疗具有一定的经验，为江都区降低新生儿死亡率起到了积极作用。
普通儿科：是以研究儿内科疾病、基础医学及儿童保健为重点、兼有医疗、教学、预防任务为一体的科室。设有门、急诊、病区，开放床位30张，儿科病房颇具现代儿科医院的特点，突出"以人为本"的新理念，为小患者营造了温馨、舒适、便利的就诊环境和就医条件。20年的临床实践中，在临床、科研和教学方面取得了很好的成绩，培养和锻炼了一批优秀人才，加之高超的医疗技术深受广大患者家长的欢迎。科室有完善的诊疗体系，建立了特色服务科室。雾化室：通过雾化吸入法治疗小儿肺炎、慢性咳嗽、哮喘；。理疗室：通过理疗治疗慢性腹泻、慢性咳嗽。在治疗儿童疾病中取得了非常显著的疗效。
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