全县唯一治疗各类传染病的临床专科，设两个病区，分别为呼吸道传染病区及特需病区。开设床位36张，病房严格按照传染病医院消毒、隔离病房要求设置，布局合理。室内设有空调、空气消毒机、独立卫生间、现有医师2人、主管护师1人，护士2人，护师1人。
收治各类型病毒性肝炎，重症肝炎、慢性活动性肺结核、肝硬化、流行性脊髓膜炎，化脓性及结核性脑膜炎、肠道传染病、肺结核、性病等法定传染病。对治疗慢性肝炎、重症肝炎、孕妇肝炎和结核性脑膜炎等均有特点及丰富经验。在六安地区率先开展艾滋病患者免费抗病毒治疗，定期复查，跟踪病程，心理干预。科室本着“一切为病人、一切方便病人”的宗旨，在该院设有专科门诊，病房24小时接待病人。
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