伊犁州新华医院感染科成立于1954年，是伊犁州历史最悠久的感染科，多年来一直承担着伊犁州传染病预防及救治工作。有独立的感染病门诊及感染科住院病区，传染病房是目前伊犁州最符合“两廊三区”区域划分的传染病区，使用面积约1200平方，设置床位24张。年收治各类传染病人900余人次，年门诊量6000人次。科室有伟力电脑腹水超滤回输仪一台，伟力电脑肝病治疗仪一台，心电监护仪2台。目前科室医护人员19名，副主任医师4名，主治医师1名，住院医师5名。护理人员9名;护理师3名，护士6名。
感染科医务人员均是从事感染病临床工作多年的资深人员，有着丰富的临床工作经验。学科带头人是是新疆中西医结合学会肝病专业委员会委员，新疆医院协会传染病管理专业委员会委员，新疆医学会第四届感染病学专业委员会委员。
对乙肝、丙肝抗病毒治疗，艾滋病抗病毒和抗机会性感染治疗已与国内传染病专科同步。在伊犁州开展了腹水浓缩回输治疗顽固性腹水，经皮B超引导下肝脏活体组织穿刺活检术等填补了伊犁州空白。开展的乙肝五项定量检测,乙肝基因分型及耐药检测，人工肝支持系统行血液灌流术。填补了本州肝病诊断治疗技术空白。对常见肝病，如对急、慢性肝炎，重型肝炎的诊治，肝炎后肝硬化失代偿期的诊治，普通传染病如百日咳，猩红热，急性细菌性痢疾，流行性腮腺炎，麻疹及并发症等诊断及治疗处于伊犁州领先水平。新发传染病的诊治，HIV感染的抗病毒治疗及机会性感染的诊治。在伊犁河流域传染病诊治工作中发挥重大作用。感染科全体医护人员无论从传染病的预防、诊疗、护理等方面精心服务于每一位患者。
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