消化内科是民航总医院主要临床科室之一，集临床、教学和科研为一体。科室所有医生均为研究生毕业，专业理论扎实，技术力量雄厚，临床经验丰富。
迄今为止，消化内科有主任医师2名，副主任医师1名，主治医师1名。消化内科有9名医师，其中2名博士，硕士研究生6名。今年预计招硕士研究生以上学历以上3名。医师队伍正逐年扩大。
消化内科分为：消化门诊、内窥镜室和病房三部分。病房开放床位35张。
学科带头人：于久飞，医学硕士，主任医师，北京大学医学部副教授。
科室主要诊治的疾病有：（1）消化系统危重、急症，如消化道大出血、休克、重症急性胰腺炎、肝昏迷、食物药物中度等。
（2）消化系统常见病、多发病，如胃溃疡、十二指肠溃疡、胃食管反流病、胃炎、肠炎、肝硬化、胆囊炎、胆石症、炎症性肠病（溃疡性结肠炎、Crohn病）、食管胃肠肝胆胰肿瘤等。
（3）各系统肿瘤的化疗。在危急重症方面积累了丰富的临床经验。拥有目前最先进的日本Olympus260型电子胃镜（具备NBI功能）、电子十二指肠镜、电子结肠镜。开展了多种内镜下诊断及治疗项目，如：粘膜染色、食管/胃/结肠息肉内镜下电凝切除、食管支架置入、食管静脉曲张破裂出血套扎治疗、内镜下取异物、内镜下止血、逆行胰胆管造影、乳头切开取石、鼻胆管引流、胆道支架置入、内镜下胃造瘘术等。内镜医师技术娴熟、操作轻柔，诊断准确率高，患者痛苦小。
消化内科在2009年进行了多例食管静脉曲张硬化治疗及套扎治疗，取得了非常好的疗效。ERCP数量较前年增加。并开展了无痛胃镜及肠镜，使服务更加人性化。
消化内科的工作宗旨是：以饱满的热情，尽职尽责地为病人提供最优质的医疗技术服务，尽最大努力为病人解除病痛。
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