二病区设有内分泌科、耳鼻喉科、眼科三个专科，共有医护人员30名，其中内分泌科医生7名（主任医师1名、主治2名，住院医师3名、助理医师1名）；耳鼻喉科医生4名（主任医师1名、副主任医师1名、住院医师1名、助理医师1名）；眼科医生6名（副主任医师1名、住院医师4名，技（验光）师1名）；护理人员13名（副主任护师1名，主管护师1名，护师7名，护士4名）。
【内分泌科】内分泌科（内三科）2017年2月独立建科，设有病床15张；2018年7月，内分泌科与耳鼻喉科组建二病区，共有床位25张；2018年8月，成立糖尿病管理中心；2019年，内分泌科有床位25张；2020年5月，成为县级内分泌重点专科。
目前，内分泌科拥有医疗设备：722胰岛素泵、动态血糖监测仪、周围神经检测仪、近红外线治疗、电子脉冲仪及火罐、艾灸盒、艾灸条等中医外治设备。
中西医结合治疗内分泌科常见多发病，如2型糖尿病、1型糖尿病、甲状腺功能亢进症、甲状腺功能减退症。以及尿崩症、库欣综合症、原发性醛固酮增多症等少见病的诊治。开展中医非药物疗法，主要有穴位贴敷、耳穴埋豆、敷药疗法、熏洗疗法、艾灸、推拿、刮痧、红外线、穴位注射、中频脉冲、中医定向透药等。
【耳鼻喉科】尤溪县中医医院建院之初，耳鼻咽喉科疾病的治疗业务由五官科统一接诊。2014年7月，五官科正式分为眼科、耳鼻咽喉科。耳鼻咽喉科独立，设有床位5张，现与内分泌科为同一个病区。
目前，拥有耳鼻喉科有耳鼻喉综合治疗台（Suntem牌）、耳科旋转椅（Suntem牌）、鼓气电窥镜、耳钻（日本NSK）、纤维喉镜、间接喉镜、直接喉镜、鼻咽喉镜、前鼻镜、电测听器（国际听力DNA260）、鼻内窥镜及手术系统、声阻抗仪、多导睡眠呼吸监测仪、五官科多用显微镜、电动吸引器、脑干诱发电位仪、低温等离子治疗仪等医疗设备。
用中西医结合的方法治疗耳鼻咽喉科常见病、多发病，对疑难及危急重症的疾病也积极参与抢救。能独立开展鼻窦开放术、鼻息肉摘除术、鼻中隔偏曲矫正术及在低温等离子下行下鼻甲消融术；在低温等离子下行扁桃体摘除术、悬雍垂腭咽成形术；在支撑喉镜下声带小结（息肉）摘除术；慢性化脓性中耳炎行乳突根治术、鼓室成形术等，特别对慢性化脓性中耳炎患者可“带脓”手术，解决了以往此类患者需“干耳”3个月后才能手术治疗的难题，不仅填补了该县空白，这是一个汇聚权威专家手术治疗成果，又是一次中耳炎患者治疗史上的重大突破。积极开展中医非药物疗法，目前主要开展的项目有穴位注射、穴位敷贴、耳穴治疗、放血治疗、中药雾化等治疗。
【眼科】发展历程2014年7月，尤溪县中医医院将五官科分设为眼科和耳咽鼻喉科，共设置床位13张。眼科是“中国健康扶贫定点医院”“复明工程”定点工作单位，近十年白内障项目年手术量位居全市综合性医院第二位。
拥有美国白内障超声乳化仪、德国莱卡显微镜、全自动视野仪、日本尼德克全自动非接触眼压仪、日本尼德克免散瞳眼底照相机、澳大利亚角膜地形图仪、日本拓普康全自动验光仪及角膜曲率仪和A超等先进设备。
开展白内障、青光眼、泪道堵塞、翼状胬肉、斜视、眼内容物剜除等最先进的显微手术治疗及眼科常见病、多发病及疑难病的诊治。
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