外科集医疗、教学、科研为一体的综合专业科室，现有开放床位60张，医生14人：主任医师1人，副主任医师4人，主治医师5人；其中博士1人，硕士6人。拥有最先进德国西门子腹腔镜、美国史赛克胸腔镜、多功能肛肠治疗仪等先进设备。科室学科带头人于游博士为该院引进人才，胃肠外科博士，副主任医师，重庆市“三峡之光”访问学者，国内外发表论文近15篇。
病区含普外科及普胸外科两个专业。普外科包括胃肠及肛肠专科、乳腺及甲状腺专科，专治胃肠、肛肠、乳腺、甲状腺疾病。于2008年开展吻合器痔上粘膜环切术（PPH术）、2012年开展腹腔镜乙状结肠良性肿瘤切除术，2013年开展腹腔镜阑尾切除术，腹腔镜下疝修补，小肠穿孔修补术、肠粘连松解术，腹腔镜结直肠癌根治，腹腔镜胃癌根治术。微创手术在区区医院及渝西地区处于领先地位。
普胸外科：专治肺癌、食管癌、纵隔肿瘤、气胸及胸部创伤等疾病，并先于其他区区医院将胸腔镜微创技术应用于胸外科手术，目前能开展：胸腔镜下肺大疱切除术；胸壁、纵隔肿瘤切除术、肺楔形切除术、胸腺瘤切除术、胸膜腔探查、活检术。使上述疾病能不开大刀而获治愈。肺癌、食管癌只需小切口即可完成手术。肋骨切开内固定手术能是患者减轻痛苦、快速康复。
目前该科收治病员平均约220人次/月，门诊约700人次/月，年手术1千余台次。自2008年来科室先后发表论文20余篇，有市区级科研项目，承担了重庆医科大学及重庆医药高专的临床教学及一级医院的进修人员教学任务，并承担基层卫生人员的培训工作。
科室坚持将医疗质量、医疗安全放在首位，充分发挥他们的综合实力。通过增大科技含量着手，该科积极开展新项目、新技术，扩大原有技术的影响力，加强与上级医院的合作与联系，不断学习新观点、新知识。应用新技术，保障医疗技术水平持续不断的提高，更好地为璧山人民的健康事业服务！
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