感染科创建于20世纪70年代，经过40多年的发展壮大，逐步完善成为集科研、教学、临床为一体的急性感染病科，是医院处置突发传染病的窗口。
该科现有医护人员20余人，主任医师2人，副主任医师1人，主治医师2人，主管护师4人，其中余治清主任医师是衡阳地区处置突发公共卫生事件的专家组成员。主要诊治范围：各类急性传染病，包括肝炎、结核、伤寒、痢疾、麻疹、流行性腮腺炎、水痘、流脑、乙脑、破伤风、白喉、狂犬病、钩体病、不明原因发热等。从2002年以来开展胸腔闭式引流术，进一步完善胸腔积液、气胸的诊治，显著提高治疗效果，缩短了病程，并大大减少了并发症。
对各类脑炎、脑膜炎的诊断与治疗有独到的经验，多年坚持的诊断性腰椎穿刺术及鞘内药物注射，显著提高了各类脑炎、脑膜炎的治疗水平，并有效地降低了并发症及后遗症。
2006年12月，余治清主任医师诊断出省内首例C群流行性脑膜炎球菌引起的流脑，特别是沈颖主持的《2006年衡阳地区麻疹大流行分析》、《268例肝硬化医院内感染分析》，为麻疹的预防、肝硬化院内感染的诊治与控制提供了丰富的理论和临床经验。
如今该科已成为衡阳地区重点发展科室之一，科室坚持“病人第一，服务第一”的服务宗旨，以精湛的医疗技术、优质的服务、舒适的环境为衡阳人民的健康服务。
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