感染性疾病科成立于20世纪70年代，前身为传染科。2007年因发展需要，原发热门诊、肠道门诊、呼吸道门诊和传染病科统一整合为感染科。感染科是医院特色专科之—，有合江县唯一传染病区，承担着全县感染病诊断治疗的重任，同时注重感染病预防的健康宣教。
感染性疾病科现有床位30张，专业医护人员12名，其中主治医师1名，住院医师3名，护师4名，护士4名。科室医护人员在感染性疾病诊断治疗方面积累有丰富的经验。
感染性疾病科负责本地区感染病诊断、治疗和科研工作，对合江县以及周边地区传染病疫情的诊治、预防和控制起到了至关重要作用，主要包括肺结核（各型结核、结核合并咯血、耐药性结核），肝炎（甲型肝炎、乙型肝炎、丙型肝炎、急性黄疸型肝炎、重型肝炎、亚急性重症肝炎），痢疾、伤寒、脑炎、脑膜炎、麻疹、手足口病、水痘、感染性休克、艾滋病等的诊治、预防和控制。
感染性疾病科独立成院，交通便利，环境优美。病区设置符合诊疗流程要求，拥有心电监护仪、输液泵、静脉注射泵、床旁心电图机等。
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