心肌炎属于自限性疾病，绝大部分心肌炎不遗留任何后遗症状。大概50%的患者在发病的2到4周，症状会逐渐缓解或消失。一部分心肌炎的患者可能会出现心脏的扩大，在几个月或几年后，可能会发展为扩张性心肌病。极少数的患者表现为爆发性心肌炎，大概有5%的患者。爆发性心肌炎的患者，在急性期可能会突然急性的
心力衰竭，缓慢性的心率失常，或恶性的
心律失常，比如室速、室颤，造成猝死，死亡率高达80%。决定心肌炎的预后，主要和感染病毒的类型、病程、临床表现以及病理的结果有关。如果患者单纯表现为胸疼，症状持续2到4天，病理可能发现
淋巴细胞性心肌炎，这样的患者预后比较好，一般不遗留任何症状。巨细胞病毒感染引起的心肌炎预后较差。患者可能需要心脏移植。
