扁平疣治疗原则需遵循患者自身扁平疣严重程度，结合医生拟定方案进行。具体分析如下：

1.当患者发现疾病后先到医院去做检查，了解清楚病情的严重性，利用合理的方法来处理疾病，按照正规医生的要求来控制扁平疣。要在医师指导下用药，避免盲目用药。

2.口服药物的治疗原则是从口服到内脏吸收到达皮肤，药物损耗程度大，可以直接杀灭病菌。若是药物治疗不理想，患者也需要利用药物治疗一段时间。

3.注射激素转基因应子：是用来提高人体免疫能力的，由于一些间接性的治疗不能彻底的治疗好病毒，治愈率就会降低，这是治疗过程中必须要注意的原则，特别是年龄比较高的人要多加注意。

4.外用药的类型：药物繁杂，一定要根据患者个人的情况来进行治疗，治疗过程中长久使用药物会对人体造成危害，所以要在医生指导下选择药物，注意药物造成的副作用，合理把握药物的危害性，在不会对身体造成伤害的情况下就尽量停止用药。

5.药物治疗的过程中，若是起不到效果，就要尽快利用手术治疗，手术治疗的效果很重要，为了能帮助患者控制疾病，我们要考虑清楚合理治疗的方法，比如面部的扁平疣原则上是不做冷冻治疗的，手部的扁平疣可以考虑进行冷冻治疗。如果长在脸部，可遵医嘱使用局部涂抹维他命A酸、水杨酸或由医师涂抹三氯醋酸，让扁平疣脱落，但需要数次的门诊治疗。激光冷冻法无法根治有些医院用激光冷冻的方法治疗。激光治疗不仅容易留下瘢痕，还无法根治。因为激光只能除去能看得见的疣体，无法除去看不见的病毒。冷冻治疗容易留下色素沉着同样也无法冻死处于皮肤深处的病毒。

建议患者最好不要用手去挠扁平疣，预防疤痕的出现。